Объяснение
Документная модель хранит связанные поля вместе. Встраивание упрощает чтение целого документа, ссылки уменьшают дублирование. «Без схемы» означает ответственность приложения за структуру, а не отсутствие структуры.
Задача для самостоятельного решения
Встраивать ли бесконечно растущие комментарии в один документ?
Показать разбор ответа
Обычно нет: размер и конкуренция записи растут. Храните отдельную коллекцию с индексом по родительскому id и пагинацией.